Berikut ini adalah struktur organisasi GPM dan GKM Fakultas MIPA Tahun 2025 berdasarkan:
SK Rektor Unsoed No. 703/UN23/JM.00/2025 tentang Gugus Penjaminan Mutu Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Jenderal Soedirman Tahun 2025–2028;
SK Rektor Unsoed No. 717/ UN23/JM.00/2025 tentang Gugus Kendali Mutu Program Studi S1 Fisika Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Jenderal Soedirman Tahun 2025–2028;
SK Rektor Unsoed No. 339/ UN23/JM.00/2025 tentang Gugus Kendali Mutu Program Studi S2 Fisika Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Jenderal Soedirman Tahun 2025–2028;
SK Rektor Unsoed No. 337/ UN23/JM.00/2025 tentang Gugus Kendali Mutu Program Studi Statistika Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Jenderal Soedirman Tahun 2025–2028
SK Rektor Unsoed No. 336/ UN23/JM.00/2025 tentang Gugus Kendali Mutu Program Studi S1 Matematika Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Jenderal Soedirman Tahun 2025–2028
SK Rektor Unsoed No. 714/ UN23/JM.00/2025 tentang Gugus Kendali Mutu Program Studi S1 Kimia Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Jenderal Soedirman Tahun 2025–2028
SK Rektor Unsoed No. 338/ UN23/JM.00/2025 tentang Gugus Kendali Mutu Program Studi S1 Kimia Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Jenderal Soedirman Tahun 2025–2028